Хосе Франсиско Торрес родился в семье мексиканского отца и американской матери. Начал карьеру игрока, выступая за команду средней школы Техаса, где его заметили скауты клуба «Пачука», с которым Торрес подписал контракт. 29 октября 2006 года Торрес дебютировал в составе «Пачуки» в матче чемпионата Мексики с клубом «Толука». Торрес быстро завоевал место в основном составе клуба, вытеснив из него Габриэля Кабальеро.

Торрес участвовал в составе «Пачуки» на клубном чемпионате мира, где провёл все три игры, и в чемпионате интер-лиги, где «Пачука» проиграла по пенальти «УНАМ Пумасу», но благодаря этому выходу в финал смогла квалифицироваться на Кубок Либертадорес.

Торрес, гражданин двух государств, мог выбирать, за какую из сборных ему выступать. Обе федерации, США и Мексики, прослеживали выступления Торреса в «Пачуке». В 2008 году Торрес был приглашён Петром Новаком в состав молодёжной сборной США на Олимпийские игры, однако футбоилст отклонил приглашение после обещания «Пачуки» поставить его в стартовый состав команды. Торрес ждал приглашения от сборной Мексики, однако главный тренер команды Уго Санчес не вызывал Торреса.

Несмотря на отказ поехать на Олимпиаду, «Пачука» регулярно получала приглашения от сборной США, желавшей видеть Торреса в своём составе. 2 октября 2008 года Торрес заявил о желании выступать за Соединённые штаты, после чего был призван Бобом Брэдли в состав команды. Это событие вызвало бурную полемику в мексиканских СМИ. Генеральный секретарь Мексиканской федерации футбола заявил, что «Торрес не имеет сердца», выбрав США, однако сам футболист сказал, что он стал играть за сборную Соединённых штатов из-за того, что руководство сборной Мексики не проявляло интереса к игроку.

11 октября 2008 года Торрес дебютировал в составе сборной США в матче со сборной Кубы.

Статистика:
Матчи: 1
Минуты: 45
Средняя оценка за матч: 5,0